वैकल्पिक मानव शारीरिक प्रणाली जो स्थूल पदार्थ से भिन्न तल पर विद्यमान है, लेकिन भौतिक शरीर की शारीरिक रचना के साथ कुछ हद तक मेल खाती है। सूक्ष्म शरीर के विभिन्न भागों में शिव और शक्ति नामक देवताओं के सूक्ष्म रूप होते हैं, जिन्हें ब्रह्मांड के पीछे की शक्तियाँ माना जाता है। इस प्रकार सूक्ष्म शरीर स्थूल जगत और सूक्ष्म जगत की समरूपता या आवश्यक समानता के सिद्धांत पर आधारित है, जो उपनिषदों के समय से ही एक मौलिक हिंदू विचार है। सूक्ष्म शरीर का वर्णन करने वाले संस्कृत ग्रंथ मानते हैं कि वास्तविकता के विभिन्न तल हैं, और इस प्रकार सूक्ष्म शरीर वास्तव में मौजूद है, लेकिन इसके साथ जुड़े प्रतीकों के नेटवर्क को देखते हुए, प्रत्येक चक्र पर कमल की पंखुड़ियों में संस्कृत वर्णमाला का एक अक्षर होता है, इस प्रकार सभी पवित्र ध्वनियों को समाहित करता है। सूक्ष्म शरीर के कुछ मॉडल और भी अधिक विकसित हैं, जिनमें प्रत्येक चक्र एक निश्चित रंग और एक निश्चित अधिष्ठाता देवता से जुड़ा हुआ है। ये केंद्र सिर के शीर्ष पर "हजार पंखुड़ियों वाले कमल" (सहस्रदलपद्म) से ढके हुए हैं, जो मानव शरीर में शिव का निवास है। सभी केंद्रों को जोड़ने वाली तीन ऊर्ध्वाधर चैनल (नाड़ियाँ) हैं - बाईं ओर इड़ा नाड़ी, दाईं ओर पिंगला नाड़ी और केंद्र में सुषुम्ना। मूलाधार चक्र के चारों ओर तीन बार कुंडलित कुंडलिनी है, जो सभी मनुष्यों में छिपी आध्यात्मिक शक्ति है। इसे सार्वभौमिक शक्ति या स्त्री दिव्य शक्ति का एक पहलू माना जाता है, लेकिन अधिकांश लोगों में इसे निष्क्रिय माना जाता है, जिसका प्रतीक इसकी कुंडलित अवस्था है। सूक्ष्म शरीर के विपरीत छोर पर शक्ति
